Thais Fujinaga graduou-se no curso Superior do Audiovisual da ECA-USP em 2008. Desde então, desenvolve projetos autorais de ficção, tendo realizado cinco curtas-metragens. Os dois últimos, L e Os Irmãos Mai, participaram de dezenas de festivais de prestígio, tanto no Brasil, quanto no exterior, e ganharam, juntos, mais de 60 prêmios e menções especiais, com destaque para: 62º Festival de Berlim, 44º Festival de Brasília do Cinema Brasileiro, 26º Festival de Cine de Mar del Plata, 33º Festival de Havana, 22º Festival Internacional de Curtas de São Paulo, 15ª Mostra de Cinema de Tiradentes, 16º Cine-PE, 23º Curta Cinema, entre outros.
Foi contemplada em quatro edições dos editais de desenvolvimento de projeto do Fundo Setorial do Audiovisual. Os roteiros de Continente e O Filho Plantado, seus projetos autorais de longa-metragem, foram selecionados para laboratórios e encontros de coprodução importantes, como o BrLab, Cinéma en Dévelopement, Brasil CineMundi e Laboratório Novas Histórias. Ambos ganharam o concurso de roteiro “Cabíria” (edições de 2016 e 2017), criado em parceria com o Geena Davis Institute on Gender in Media com o objetivo de premiar obras com protagonistas femininas relevantes. Em 2019, foi uma das selecionadas do Berlinale Talents, onde apresentou seu projeto Continente.
Thais também roteirizou o longa-metragem A Cidade Onde Envelheço, da cineasta mineira Marília Rocha (filme que teve sua estreia mundial na competição do Festival de Rotterdam de 2016, e estreia nacional no Festival de Brasília do Cinema Brasileiro, onde recebeu quatro prêmios, entre eles o de Melhor Filme, premiação repetida também no Festival de Biarritz). Escreveu roteiros para séries da Netflix e HBO, tendo colaborado com diretores como Juliana Rojas e Fernando Coimbra, Fernando Meirelles e Cao Hamburger. Seus últimos trabalhos como roteirista foram a 2º temporada de Pico da Neblina (O2 e HBO), o roteiro do longa Talismã, que será dirigido por Sandra Kogut, e a adaptação do livro argentino Garotas Mortas.
Desde 2008 atua como consultora de roteiro e professora em cursos organizados pela Academia Internacional de Cinema, SESC, Secretaria Municipal de Cultura de São Paulo, entre outras instituições. Também organizou e ministrou aulas gratuitas em oficinas voltadas para mulheres negras e outra para pessoas trans.